港口航道與海岸工程專業：1956年開始辦學，先后入選首批國家級一流本科專業建設點、國家第一類特色專業、教育部卓越工程師培養計劃，是湖南省唯一設置該專業的高等院校。已通過國家工程教育專業認證，是我國第二個通過認證的港航專業，2020年艾瑞深校友會排名位列水利類一流專業全國第3，2021軟科中國大學專業排名第7，2022年校友會中國大學排名位列水利類一流專業排名并列第4。

水利水電工程專業：1956年開始辦學，先后入選國家級一流本科專業建設點、首批湖南省一流本科專業建設點、湖南省特色專業、教育部卓越工程師培養計劃，已通過國家工程教育專業認證，2021軟科中國大學專業排名第14，2022年校友會中國大學排名位列水利類一流專業排名第18。

水文與水資源工程專業：1956年開始辦學，入選湖南省一流本科專業建設點，是湖南省唯一設置該專業的高等院校，2021軟科中國大學專業排名第18。

給排水科學與工程專業：1999年開設，入選湖南省一流本科專業建設點、長沙理工大學重點學科專業，2021軟科中國大學專業排名第23。

環境工程專業：2001年開設，長沙理工大學重點建設專業，2021軟科中國大學專業排名評為B級。

船舶與海洋工程專業：起源于學校1979年開始本科辦學的“港口航道與海岸工程”和“船舶機械”專業，港航專業設有“海洋工程”方向，“船舶機械”與學校其它機械類專業融合，2017年新開設“船舶與海洋工程”專業，是湖南省唯一設置該專業的高等院校。

地理信息科學專業：結合“新型基礎設施建設”，面向智慧水利、智慧城市全面布局新工科領域，2021年開設的新專業。

辦學六十多年來，學院培養了一大批水利、水運、水務、生態環保系統業務精英、各級黨政領導干部、大型國企央企管理骨干和眾多高級工程技術人才。涌現出多位中國工程院院士候選人、享受國務院政府特殊津貼專家、全國“五一勞動獎章”獲得者、“全國脫貧攻堅先進個人”、各級“勞動模范”、“先進工作者”等杰出校友。

2021年水利與環境工程學院錄取分數和位次